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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

广东首个国家级文化生态保护区通过验收******

　　中新网广州2月2日电 (记者 程景伟)据广东省文化和旅游厅2日通报，文化和旅游部近日公布国家级文化生态保护区名单，客家文化(梅州)生态保护实验区成功通过验收，成为广东省首个国家级文化生态保护区。

　　梅州是国家历史文化名城，是客家先民历经多次迁徙的落脚点，也是明、清以来客家人衍播四海的主要出发地，享有“世界客都”“世界长寿之都”等众多美誉。

　　客家文化(梅州)生态保护实验区于2010年5月获批设立，位于广东省东北部，地处粤闽赣三省交界处，覆盖梅州市全境8个县(市、区)，面积1.58万平方公里，其中，划定梅州市梅江区、梅县区、兴宁市和大埔县为重点区域。

　　多年来，梅州聚焦客家非遗题材，把实施文艺精品工程作为加快文化名城建设的重要内容，创演山歌剧《白鹭村》《春闹》《林风眠》等一批具有岭南气派、客家风格、梅州特色的精品力作。

　　同时，梅州鼓励侨胞和社会贤达积极参与客家文化(梅州)生态保护实验区建设，争取到68亿元的社会资金参与客家民居修缮、非遗街区建设、文物和传统村落保护等。

　　广东省文旅厅有关负责人表示，客家文化(梅州)生态保护实验区建设将进入新阶段，进一步释放梅州客家文化新活力，助力梅州老区苏区振兴发展、对接融入粤港澳大湾区加快振兴发展、文化强省建设和梅州高质量发展。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）